La Facultad de Artes y Ciencias, organizada en 1903, incluyó un Programa de Educación General en el que ofreció un curso introductorio de biología general. Aquí descansa el origen de nuestro Departamento y del curso regular de Ciencias Biológicas.
En la Facultad de Estudios Generales, organizada a raíz de la reforma universitaria de 1942, el curso de Ciencias Biológicas fue desde sus inicios uno medular. Su propósito principal era relacionar a los estudiantes con el mundo orgánico que los rodeaba. En sus comienzos, el énfasis del curso fue a nivel de organismo. Para el año 1952 se enfatiza la relación de estructura y función de la célula viva; a partir de 1965, en el área de la genética y se enriquece el área de evolución; y desde 1970, se enfatiza la ecología y se empieza a ofrecer el periodo de laboratorio a los estudiantes del curso. En 1999 se abre una convocatoria para presentar propuestas de nuevos cursos, a raíz de la cual se presentan y aprueban cinco cursos.
Actualmente el Departamento ofrece siete cursos medulares y un curso electivo, cada uno de un semestre.